Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Hoxc13P50207 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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