Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Cdkn1bP46414 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms