Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TtlP38585 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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TtlP38585 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
TtlP38585 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
TtlP38585 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms