Protein–RNA interactions for Protein: P35293

Rab18, Ras-related protein Rab-18, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab18P35293 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
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Rab18P35293 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab18P35293 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Rab18P35293 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rab18P35293 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab18P35293 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rab18P35293 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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