Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cd28P31041 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cd28P31041 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cd28P31041 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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