Protein–RNA interactions for Protein: P28312

Defa5, Alpha-defensin 5, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa5P28312 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Defa5P28312 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms