Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ChgaP26339 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms