Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
NefhP19246 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NefhP19246 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NefhP19246 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NefhP19246 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms