Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Tnnc1P19123 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms