Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PcnaP17918 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms