Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ptbp1P17225 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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