Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Obox1-206ENSMUST00000181001 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Hoxb4P10284 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118 ms