Protein–RNA interactions for Protein: P0DM65

Becn2, Beclin-2, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Becn2P0DM65 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Becn2P0DM65 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Becn2P0DM65 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms