Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Hoxa5P09021 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Hoxa5P09021 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms