Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sod1P08228 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sod1P08228 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms