Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Mtnd1P03888 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Mtnd1P03888 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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