Protein–RNA interactions for Protein: P01741

Ig heavy chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01741 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
P01741 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
P01741 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
P01741 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms