Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
P01649 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
P01649 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
P01649 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms