Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01644 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01644 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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P01644 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01644 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01644 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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