Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
DffaO54786 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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DffaO54786 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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DffaO54786 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
DffaO54786 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
DffaO54786 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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