Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sdc4O35988 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sdc4O35988 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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