Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Sp100O35892 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Sp100O35892 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms