Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Dgcr6O35347 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Dgcr6O35347 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Dgcr6O35347 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms