Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Slc18a3O35304 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Slc18a3O35304 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms