Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Kcns1O35173 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Kcns1O35173 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Kcns1O35173 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Kcns1O35173 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Kcns1O35173 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Kcns1O35173 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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Kcns1O35173 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Kcns1O35173 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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