Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hps1O08983 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms