Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Eftud2O08810 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms