Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
MsmbO08540 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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