Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Usp35M0QWN7 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Usp35M0QWN7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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