Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm20877J3QPZ4 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms