Protein–RNA interactions for Protein: J3QPN2

Gm21870, Predicted gene, 21870, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21870J3QPN2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21870J3QPN2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms