Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Gm2035J3QP87 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms