Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smim18J3QNP2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim18J3QNP2 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms