Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Tmem200cJ3QK46 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms