Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms