Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm21863J3KMP8 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms