Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI9

Gm21719, Predicted gene, 21719, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21719J3KMI9 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21719J3KMI9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21719J3KMI9 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21719J3KMI9 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21719J3KMI9 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21719J3KMI9 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Gm21719J3KMI9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21719J3KMI9 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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