Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Taf4bG5E8Z2 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf4bG5E8Z2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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