Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Sclt1G5E861 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms