Protein–RNA interactions for Protein: F8VPT3

Lct, Lactase, mousemouse

Predictions only

Length 1,931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LctF8VPT3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
LctF8VPT3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LctF8VPT3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms