Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 B2m-201ENSMUST00000102476 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 AU016765-201ENSMUST00000097295 946 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ttc37F8VPK0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm14232-201ENSMUST00000137176 446 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc37F8VPK0 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms