Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
H2-M1F7CXU4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms