Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm3371F7CQW8 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms