Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm28048F7BCN0 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Gm28048F7BCN0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28048F7BCN0 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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