Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm340F6RGI3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms