Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc146E9Q9F7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms