Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fndc1E9Q043 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fndc1E9Q043 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms