Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms