Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Brd1E9PZ26 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms