Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Syde2E9PUP1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms